Özet: Denizlerin derinliğinde yaşayan küçük bir Japon balığı olan Ponyo, bir gün yeryüzünü keşfetmek için babasından kaçar ve kıyıdaki bir cam kavanoza sıkışır. Onu bulup kurtaran 5 yaşındaki Sosuke, minik dosta "Ponyo" adını verir ve aralarında güçlü bir bağ oluşur. Sosuke’ye duyduğu sevgi nedeniyle bir insana dönüşmek isteyen Ponyo, babasının güçlü büyülerini kullanarak bir kız çocuğuna dönüşür; ancak bu durum doğanın dengesini bozarak dev bir tsunamiye ve denizlerin taşmasına neden olur. Ponyo ve Sosuke, dünyanın dengesini yeniden sağlamak ve Ponyo'nun insan kalabilmesini başarmak için el ele verip büyülü bir serüvene atılırlar.